Boa pergunta.
Na realidade ambas elas exigem vidro de alta qualidade. A 50D com o seu sensor de 15MP, não oferece clemência ás objectivas.
Dito isto, e é uma discussão muito actual e na qual tenho vindo a participar em outros locais, para comprar uma 50D tem de existir um orçamento para vidro bom, ou já o possuir claro está.
A 5D é optima, mas o processamento de imagem da 50D é muito mais recente e avançado. Claro que uma FF é sempre uma FF, mas até que ponto precisas de uma?
Caso o orçamento não seja muito largo, acho que deves optar por uma 40D. A 50D com objectivas medias apresenta resultados piores do que a 40D.
Mas estamos a falar de maquinas onde a diferença de qualidade é minima. Eu pessoalmente acho que a 50D só se justifica para pessoas que trabalham muito com ampliações e que tem vidro L.